可能考点:
- 20种氨基酸的默写
- 蛋白质的二级结构
- 蛋白质的超二级结构
- 蛋白质三级结构/四级结构
二十种氨基酸的默写
单字母 | 三字母 | 全称 | 中文 |
---|---|---|---|
G | Gly | Glycine | 甘氨酸 |
A | Ala | Alanine | 丙氨酸 |
P | Pro | Proline | 脯氨酸 |
V | Val | Valine | 缬氨酸 |
L | Leu | Leucine | 亮氨酸 |
I | Ile | Isoleucine | 异亮氨酸 |
M | Met | Methionine | 甲硫氨酸 |
F | Phe | Phenylalanine | 苯丙氨酸 |
Y | Tyr | Tyrosine | 酪氨酸 |
W | Trp | Tryptophan | 色氨酸 |
S | Ser | Serine | 丝氨酸 |
T | Thr | Threoine | 苏氨酸 |
C | Cys | Cysteine | 半胱氨酸 |
N | Asn | Asparagine | 天冬酰胺 |
Q | Gln | Glutamine | 谷氨酰胺 |
D | Asp | Aspartic acid | 天冬氨酸 |
E | Glu | Glutamic acid | 谷氨酸 |
K | Lys | Lysine | 赖氨酸 |
R | Arg | Arginine | 精氨酸 |
H | His | Histidine | 组氨酸 |
二十种氨基酸的分类
- 脂肪族氨基酸: G, A, V, L, I
- 含羟基或巯基侧链的氨基酸: S, C, T, M
- 环状氨酸: P
- 芳香族氨基酸: F, Y, W
- 碱性氨基酸: H, K, R
- 酸性氨基酸: D, N, E, Q
蛋白质的二级结构
最常见的二级结构包括: α螺旋 (α helix):一种右手螺旋结构,氢键稳定其形状。 β折叠 (β conformation):由多条平行或反平行的肽链组成,形成片状结构。 β转角 (β turns):肽链急剧转向的结构,通常由少数氨基酸组成。
α螺旋
α螺旋是一种右手螺旋。氢键使螺旋稳定并保持规则的形状。 每个α螺旋有 3.6个氨基酸残基完成一整圈。α螺旋每旋转一圈沿轴线向前移动 5.4 Å (埃)。沿螺旋轴,每个氨基酸残基的上升量约为 1.5 Å。 倾向形成α螺旋的氨基酸:Ala,Leu,Glu,Met 限制α螺旋的氨基酸:Pro,Gly
β折叠
β折叠由肽链呈“锯齿形”扩展构成,形成平面状的片层结构。平行β折叠:肽链方向一致。反平行β折叠:肽链方向相反。β折叠中,侧链交替分布于片层的两侧,一侧通常为疏水性,另一侧为亲水性
倾向形成β折叠的氨基酸: Val、Ile、Phe:疏水性较强,适合稳定折叠。 Thr、Tyr、Trp:侧链体积较大,能参与片层结构的堆积
β-turn
蛋白质的超二级结构
Helix-Turn-Helix
Hairpin β motif
Greek key motif
β-α-β motif
β strands
β Barrel
某些被称为motif的组合经常出现,包括螺旋-环-螺旋基序和发夹基序。
β-α-β基序由两条由α螺旋连接的平行β链组成,几乎出现在所有具有平行β片的结构中。四条以特定方式排列的反平行β链组成希腊键基序,该基序经常出现在具有反平行β片的结构中。
蛋白质家族
Coiled-coils α螺旋
含有重复的七肽氨基酸序列
α/β
α+β