第1章 蛋白质的结构层次


可能考点:

  • 20种氨基酸的默写
  • 蛋白质的二级结构
  • 蛋白质的超二级结构
  • 蛋白质三级结构/四级结构


二十种氨基酸的默写

单字母三字母全称中文
GGlyGlycine甘氨酸
AAlaAlanine丙氨酸
PProProline脯氨酸
VValValine缬氨酸
LLeuLeucine亮氨酸
IIleIsoleucine异亮氨酸
MMetMethionine甲硫氨酸
FPhePhenylalanine苯丙氨酸
YTyrTyrosine酪氨酸
WTrpTryptophan色氨酸
SSerSerine丝氨酸
TThrThreoine苏氨酸
CCysCysteine半胱氨酸
NAsnAsparagine天冬酰胺
QGlnGlutamine谷氨酰胺
DAspAspartic acid天冬氨酸
EGluGlutamic acid谷氨酸
KLysLysine赖氨酸
RArgArginine精氨酸
HHisHistidine组氨酸

二十种氨基酸的分类

  • 脂肪族氨基酸: G, A, V, L, I
  • 含羟基或巯基侧链的氨基酸: S, C, T, M
  • 环状氨酸: P
  • 芳香族氨基酸: F, Y, W
  • 碱性氨基酸: H, K, R
  • 酸性氨基酸: D, N, E, Q

蛋白质的二级结构

最常见的二级结构包括: α螺旋 (α helix):一种右手螺旋结构,氢键稳定其形状。 β折叠 (β conformation):由多条平行或反平行的肽链组成,形成片状结构。 β转角 (β turns):肽链急剧转向的结构,通常由少数氨基酸组成。

α螺旋

α螺旋是一种右手螺旋。氢键使螺旋稳定并保持规则的形状。 每个α螺旋有 3.6个氨基酸残基完成一整圈。α螺旋每旋转一圈沿轴线向前移动 5.4 Å (埃)。沿螺旋轴,每个氨基酸残基的上升量约为 1.5 Å。 倾向形成α螺旋的氨基酸:Ala,Leu,Glu,Met 限制α螺旋的氨基酸:Pro,Gly

β折叠

β折叠由肽链呈“锯齿形”扩展构成,形成平面状的片层结构。平行β折叠:肽链方向一致。反平行β折叠:肽链方向相反。β折叠中,侧链交替分布于片层的两侧,一侧通常为疏水性,另一侧为亲水性

倾向形成β折叠的氨基酸: Val、Ile、Phe:疏水性较强,适合稳定折叠。 Thr、Tyr、Trp:侧链体积较大,能参与片层结构的堆积

β-turn


蛋白质的超二级结构

Helix-Turn-Helix

Hairpin β motif

Greek key motif

β-α-β motif

β strands

β Barrel

某些被称为motif的组合经常出现,包括螺旋-环-螺旋基序和发夹基序。

β-α-β基序由两条由α螺旋连接的平行β链组成,几乎出现在所有具有平行β片的结构中。四条以特定方式排列的反平行β链组成希腊键基序,该基序经常出现在具有反平行β片的结构中。


蛋白质家族

Coiled-coils α螺旋

含有重复的七肽氨基酸序列

α/β

α+β