可能考点：
- 真核生物转录激活模型，TATA Box
- Homeodomain蛋白
- p53蛋白
真核生物转录激活模型
转录单元调节顺序分为
- 基本启动子单元TATA Box
- 启动子临近单元
- 增强子单元
TBP TATA Box结合蛋白
TBP使DNA弯曲结合到TATA Box并与RNA聚合酶等形成起始复合物。特殊转录因子与启动子临近单元的DNA或者增强子DNA结合，通过与TATA Box间隔的DNA成环折叠，和前起始复合物相互作用，共同调节基因表达。
TBP由两个亚基（五条反平行β链组成β折叠和两个α螺旋）组成，二体化形成鞍型分子，使得TATA Box DNA严重弯曲解旋，DNA小沟更开放，变宽且浅。利用蛋白质的β折叠片侧链残基和DNA碱基疏水相互作用。
Homeodomain蛋白与DNA的相互作用
Homeodomain的核心结构为螺旋-转角-螺旋
Homeodomain通常包含三个α螺旋，其中第一个和第三个螺旋通过转角连接。这个结构是DNA结合域的核心，特别是第二个螺旋（即识别螺旋）在DNA结合中起着关键作用。
第一个螺旋主要用于与DNA大沟的结合。
第二个螺旋是Homeodomain蛋白的关键DNA结合结构，直接与DNA的大沟结合并与特定的DNA序列形成氢键和疏水相互作用。
第三个螺旋有助于稳定蛋白的DNA结合结构。
p53蛋白
p53蛋白依靠两个环区域和一个C端α螺旋与DNA大沟结合。
p53通过其DNA结合域识别DNA双链的“大沟”部分。结合时，p53的两个α螺旋插入DNA的大沟，并通过氢键和疏水相互作用与DNA的碱基对相互作用。
当p53与目标DNA结合时，DNA通常会发生局部弯曲，尤其是DNA的大沟部分，这种弯曲有助于p53蛋白与DNA碱基之间的相互作用。p53的识别螺旋会插入到DNA的大沟中，与特定的碱基发生氢键和疏水相互作用。